Вячеслав, здравствуйте! Нет не навредит. В составе блоков нет агрессивных компонентов, а антибактериальный состав в 50 граммах ни как не воздействует на среду септика. Также мы используем регулярно данные блоки в доме с септиком уже длительное время. С уважением команда VMI!