Перед применением следует прокипятить наконечники в воде в течение 10+5 минут. Кружку Эсмарха в сборе с трубкой и зажимом промыть в горячей (50±5)оС воде с добавлением детского мыла. Затем следует приготовить раствор перекиси водорода в мыльной воде, из расчета 100 мл 3%-ой перекиси водорода на 1 литр мыльного раствора и пропустить этот раствор 2-3 раза через кружку в сборе с трубкой и зажимом (для трёхкратной обработки можно использовать один и тот же раствор). После обработки следует тщательно промыть кружку в сборе с трубкой и зажимом проточной водой. Перед использованием кружки конец трубки из ПВХ опустить на 1 минуту в горячую воду и надеть на наконечник, предварительно смазанный нейтральным жиром (вазелином, ланолином). После каждого использования наконечник следует промыть водой с мылом, ополоснуть чистой проточной водой. В лечебных учреждениях кружку Эсмарха дезинфицируют промыванием горячей водой температурой (50±5)ºС и выдерживают изделие в 1%-ном растворе хлорамина при температуре не ниже 18°С в течение (30+5) минут, либо двукратно протирают изделие снаружи тампоном из марли, смоченным в том же дезинфицирующем растворе. Наконечник помещают в 3% раствор перекиси водорода на 80 минут.