В соответствии с учебной программой учебник состоит из четырех частей. Часть первая, "Общая медицинская микробиология", содержит сведения об истории микробиологии, вирусологии и иммунологии, о систематике микроорганизмов, морфологии и ультраструктуре, физиологии и биохимии, генетике, микроэкологии, включает микробиологические и молекулярно-биологические основы химиотерапии. Часть вторая. "Инфектология", посвящена молекулярно-биологическим и микробиологическим аспектам патогенности и вирулентности бактерий, их токсинам, формам и видам инфекции. Часть третья, "Иммунология", содержит современные сведения о центральных и периферических органах иммунной системы, иммуногенезе, иммунопатологических состояниях и прикладной иммунологии. Часть четвертая, "Частная медицинская микробиология", включает четыре главы: "Медицинская бактериология", "Медицинская вирусология", "Медицинская микология" и "Медицинская протозоология". Специальная глава "Основы клинической микробиологии" написана для субординаторов 6-го курса, а глава "Микробиология и иммунология стоматологических заболеваний" — для студентов стоматологических факультетов. В конце каждой главы приводятся вопросы для самоконтроля.
Учебник предназначен для студентов и аспирантов всех факультетов медицинских вузов.